Le CHU de Nîmes renforce sa recherche en génomique microbienne grâce au soutien de fonds européens
Grâce à un financement du Fonds Européen de Développement Régional (FEDER), attribué parla Région Occitanie, le CHU de Nîmes vient d'acquérir un séquenceur de nouvelle génération NextSeq 2000. Cet équipement de très haute performance renforcera les capacités de la plateforme de recherche Micro&Bio.
Une plateforme au cœur de la recherche microbiologique
La plateforme technologique Micro&Bio constitue un outil stratégique pour l'étude avancée des microorganismes, de leurs communautés et de leurs interactions avec le patient ou l'environnement. Elle s’appuie sur deux plateaux complémentaires : GéMIC, spécialisé dans les analyses génomiques microbiennes et l'étude des microbiotes, et bioMONOPOLY, dédié à la caractérisation des biofilms et à l'évaluation de nouvelles stratégies antimicrobiennes.
Cette plateforme permet de couvrir l’ensemble du continuum de recherche, de la compréhension fine des génomes jusqu’à l’analyse fonctionnelle des communautés microbiennes.
Un nouvel équipement stratégique
Le NextSeq 2000 permettra d'approfondir l'analyse des génomes bactériens, viraux et fongiques, ainsi que l'étude des microbiotes complexes dans de nombreuses situations cliniques : microbiote digestif et pathologies chroniques (maladies auto-immunes, maladies inflammatoires), microbiote cutané et plaies, microbiote osseux, microbiote et santé de la femme, et bien d’autres. De plus, le séquenceur sera utilisé à la fois pour les activités du plateau Micro&Bio mais aussi pour les activités de génétique humaine, permettant notamment de mener des études de l’exome ain d’identifier à grande échelle des mutations responsables de maladies génétiques.
Ce financement inclut également l’arrivée d’un post-doctorant et l’allocation de temps de bioinformaticien, éléments indispensables pour exploiter pleinement la richesse des données générées par cette technologie de pointe.
Un engagement fort de l’Union européenne et de la Région Occitanie pour l'innovation en santé
Cet investissement de 678 K€, cofinancé par les fonds FEDER dans le cadre du programme opérationnel régional Occitanie, témoigne de l'engagement conjoint de l'Union Européenne et de la Région Occitanie pour soutenir l’innovation en santé et renforcer les capacités de recherche biomédicale sur notre territoire.
Ce projet a bénéficié du soutien du Fonds Européen de Développement Régional (FEDER).
« Grâce au soutien du FEDER et de la Région Occitanie, nous franchissons une nouvelle étape dans le développement de notre plateforme Micro&Bio. L’acquisition du NextSeq 2000 va considérablement renforcer nos capacités d'analyse en génomique microbienne et offrir de nouvelles perspectives dans la compréhension des microbiotes et de leur impact chez l’homme. C’est une avancée majeure au service de la recherche translationnelle sur notre territoire, au bénéfice de nos chercheurs et des patients. »
